Table of Contents
Chemické složení živých systémů
Biogení prvky
Makrobiogenní prvky
- nejvíce zastoupené
- tvoří až 99% hmotnosti živých buněk
- nejčastější: C,H,N,O,P,S, dále pak: Ca,K,Na,Cl,V
Oligobiogenní prvky
- mají nižší zastoupení
- Mn,Fe,Cu,Zn,F
Mikrobiogenní prvky
- nejméně zastoupené
- Co,Se,Si,Mo,J,Cr,Al,V
Voda a anorganické látky
- tvoří velkou část buňky, kolem 70%
Funkce vody
- rozpouštědlo látek
- prostředí pro průběh chemických reakcí
- reakční složka (hydrolýza)
- regulátor teploty
Anorganické ionty
- anoraganické látky jsou v buňkách většinou jako soli disociované na ionty
- <m>K^+</m>, aniontem <m>Cl^-</m> hlavní kationt a aniont intercelulárních (nitrobuněčných) tekutin
- <m>Na^+</m> hlavní kationt extracelulárních (mimobuněčných) tekutin
- <m>Ca^2+</m> kationt tělních tekutin (obsažen v tvrdých tkáních)
- <m>Mg^2+</m> kationt, který je součástí některých enzymových systémů
- fosfáty a bikarbonáty - podílejí se na stabilizaci pH v buňce
- fosfáty <m>(H_2PO_4)^-</m>, <m>(HPO_4)^2-</m>
- bikarbonát <m>HCO^3-</m>
Sodíkodraslíková pumpa
- čerpá sodík z buněk do extracelulárního prostoru a zároveň draslík dovnitř
- je přítomna v membránách všech buněk
- proces spotřebovává energii ve formě ATP
- výsledkem je sodíkodraslíkový gradient na buněčné membráně a vytvoření elktrického potenciálu (-70mV u nueronů)
- v případě podnětu vznikají změy v propustosti buněčné membrány → dojde k vyplavení K iontů ven a Na iontů dovnitř → vzniká vzruch
Nerozpustné anorganické látky
- součást ochraných a oporných struktur
- fosforečnan a uhličitan vápenatý - kostra obratlovců
- uhličitan vápenatý - schránky bezobratlých
- oxid křemičitý - schránky jednobuněčných živočichů
- uhličitan vápenatý a oxid křemičitý - zpevnění buněčné stěny rostlin
Organické látky
- skládají se z řetězců C a H
- cyklické a acyklické
Nízkomolekulární organické látky
- relativní molekulová hmotnost do 1000
- jednoduché cukry, sacharidy, aminokyseliny, nukleotidy
Cukry, sacharidy, glycidy
- jsou to organické látky tvořené při fotosyntéze
- složení: C,H,O
- obecný vzorec: <m>(CH_2O)_n</m>
- monosacharidy - jednoduché cukry
- aldózy (glyceraldehyd,ribosa,glukosa) (-COH)
- ketózy (dihydroxyaceton,ribulosa,fruktosa) (C=O)
- disacharidy, trisacharidy, … polysacharidy
- význam sacharidů
- okamžitý zdroj energie (monosacharidy, disacharidy)
- stavební látka (celulóza)
- energetická rezerva buněk
Mastné kyseliny
- karboxylové kyseliny s dlouhým uhlovodíkovým řetězcem
- dělení:
- nasycené - bez dvojných vazeb
- nenasycené - s dvojnou vazbou (vazbami)
Nasycené mastné kyseliny
Symbol | Název | Struktura |
---|---|---|
12 : 0 | laurová | CH3(CH2)10COOH |
14 : 0 | myristová | CH3(CH2)12COOH |
16 : 0 | palmitová | CH3(CH2)14COOH |
18 : 0 | stearová | CH3(CH2)16COOH |
20 : 0 | arachidová | CH3(CH2)18COOH |
22 : 0 | behenová | CH3(CH2)20COOH |
24 : 0 | lignocerová | CH3(CH2)22COOH |
Nenasycené mastné kyseliny
- vyskózní kapaliny získané lysováním rostlinných produktů (oleje)
- lidský organismus je neumí vytvořit, ale musí je přijímat jako součást potravy
Symbol | Název | Struktura |
---|---|---|
16 : 1 | palmitoolejová | CH3(CH2)5CH=CH(CH2)7COOH |
18 : 1 | olejová | CH3(CH2)7CH=CH(CH2)7COOH |
18 : 2 | linolová | CH3(CH2)4(CH=CHCH2)2(CH2)6COOH |
18 : 3 | linolénová | CH3CH2(CH=CHCH2)3(CH2)6COOH |
20 : 4 | arachidonová | CH3(CH2)4(CH=CHCH2)4(CH2)2COOH |
24 : 1 | nervonová | CH3(CH2)7CH=CH(CH2)13COOH |
Lipidy a steroidy
- skupina organických látek nerozpustných ve vodě, ale v nepolárních rozpouštědlech (hexan, benzen)
- dělení:
- deriváty mastných kyselin
- deriváty izoprenu
Lipidy
- označují se tak estery mastných kyselin
- složené z alkoholů (nejčastěji glycerolu) a mastných kyselin (popřípadě některých dalších látek)
- dělení:
- jednoduché lipidy (vosky, acylglyceroli)
- Vosky jsou jsou estery jednosytných vyšších alkoholů (cetylalkohol) s vyšší mastnou kyselinou (od 20C).
- Tuky a oleje - jsou estery vyšších karboxylových kyselin
- složené lipidy (fosfatidy,sfingolipidy, glykolipidy)
- Fosfatidy - v molekule mají kyselinu fosforečnou a dusíkatou látku. Jsou hlavní složkou biologických membrán. (kefalin, lecitin)
- Sfingolipidy
- Glykolipidy - vyskytují se v biomembránách, v pochvách nervových buněk.
Steroidy
- vznikají polymerací izoprenu
- terpeny(karotenoidy,xantofyly)
- steroly - cholesterol, žlučové kyseliny
- steroidní hormony - testosteron, progesteron, kortizol
Aminokyseliny
- znamé především jako stavební kameny proteinů, vyskytují se však i volně
- dusíkaté sloučeniny všech živých organismů a buněk
- jsou to substituční deriváty karboxylových kyselin
- každá AK má:
- jednu karboxylovou skupinu COOH
- jednu zásaditou aminoskupinu <m>NH_2</m>
- postranní řetězec R
- AK se spojují Peptidovou vazbou (-CO-NH-) a mohou vytvářet di-,tri-,tetra-,…,polypeptidy
- Peptidová vazba vzniká kondenzační reakcí karboxylové skupiny jedné AK a aminoskupinou druhé AK za odštěpení vody
Aminokyseliny, které se vyskytují v proteinech
Aminokyseliny s alifatickým postranním řetězcem
Aminokyseliny s alifatickým postranním řetězcem
- Glycin Gly (G)
- Alanin Ala (A)
- Valin Val (V)
- Leucin Leu (L)
- Isoleucin Ile (I)
S karboxylovou nebo amidovou skupinou na postranním řetězci (kyselé skupiny)
- Kyselina asparagová Asp (D)
- Asparagin Asn (N)
- Kyselina glutamová Glu (E)
- Glutamin Gln (Q)
S aminovou skupinou na postranním řetězci (basické skupiny)
- Arginin Arg (R)
- Lysin Lys (K)
S aromatickým jádrem nebo hydroxylovou skupinou na postranním řetězci
- Histidin His (H)
- Fenylalanin Phe (F)
- Serin Ser (S)
- Threonin Thr (T)
- Tyrozin Tyr (Y)
- Tryptofan Trp (W)
Se sírou v postranním řetězci
- Methionin Met (M)
- Cystein Cys (C)
Iminokyseliny
- Prolin Pro (P)
21. aminokyselina
- Selenocystein SeCys – nahrazuje cystein v lidském enzymu glutathionperoxidáze a v enzymech některých bakterií
Organické kyseliny
- jako meziprodukty základních metabolických drah jsou přítomny ve všech buňkách, ve větším množství v rostlinách.
- kyselina mléčná, jablečná, citronová, pyrohroznová
Nukleotidy
- jsou stavebními kameny nukleových kyselin
- složení:
- nukleové báze (nejčastěji purinové nebo pyrimidinové)
- pětiuhlíkatého monosacharid - pentóza (ribóza, deoxyribóza)
- kyselina trihydrogenfosforečná <m>H_3PO_4</m>
AMP
- adenozinmonofosfát
- tvoří základ nukleotidů, častěji se vyskytují jeho deriváty
ADP, ATP
- adenozindifosfát,adenozintrifosfát
- díky makroergickým vazbám jsou mezi fosfátovými skupinami energeticky bohaté
- jejich hydrolýzou se v buňce uvolňuje velké množství energie
Vysokomolekulární organické látky
- vznikají kondenzací z látek nízkomolekulárních, označují se jako polymery
- relativní molekulova hmotnost vyšší než 1000
Polysacharidy
- vźynikají kondenzací monosacharidů za vzniku glykosidické vazby
- olygogklikosidy: disacharidy: sacharóza - řepný cukr (glukóza+fruktóza), laktóza - mléčný cukr (glukóza+galaktóza)
- polygklikosidy: škrob (glukóza), glykogen (glukóza), celulóza (glukóza)
Proteiny
- vznikají kondenzací aminokyselin při proteosyntéze
- jsou spojeny peptidovými vazbami
- proteiny všech organismů obsahují 20 základních aminokyselin
- složení:
- N-konec tvořený aminoskupinou <m>-NH_2</m>
- polypeptidový řetězec
- C-konec tvořený kyselou skupinou <m>-COOH</m>
- rozdílnost je dána postranními řetězci <m>R_n</m>
- Primární struktura je tvořena posloupností aminokyselin v polypeptidovém řetězci.
- Sekundární struktura tvořena vodíkovými vazbami mezi skupinami peptidové vazby (alfa-šroubovice,skládaný list).
Nukleové kyseliny
- jsou to heteropolymery tvořené opakujícími se jednotkami - nukleotidy
- složení nukleotidu
- pětiuhlíkatý cukr (pentóza)
- fosfátová skupina (<m>H_3 PO_4</m>) kyselina trihydrogenfosforečná
- dusíkatá purinová (G - guanin, A - adenin) nebo pyrimidinová báze (C - cyozin, T-thymin, U - uracil)
- kondenzací nukleotidů vzniká polynukleotidové vlákno
DNA
- deoxyribonukleová kyselina
- tvořena dvěma antiparaleními polynukleotidovými řetězci (5'→3'; 3'→5')
- sacharidová složka je tvořena deoxyribózou
- Chargaffova pravidla
- adenin se páruje s thyminem (tvoří 2 vodíkové vazby)
- guanin se páruje s cytosinem (tvoří 3 vodíkové vazby)
- díky velkému množství vodíkových vazeb je relativně stabilní
- sekundární struktura většinou alfa-helix - pravotočivá šroubovice konformace B
- ssDNA single stranded DNA
- dsDNA double stranded DNA
- denaturace DNA jev, kdy vlivem okolních podmínek (teplota,pH) dojde k oddělení obou vláken DNA. Za vhodných podmínek mlže být reverzibilní (hybridizace).
RNA
- ribonukleová kyselina
- tvořena většinou jen jedním polynukleotidovým vláknem
- sacharidová složka je tvořena ribózou
- dusíkaté báze tvoří (G - guanin, A - adenin, C - cyozin a U - uracil)
- může vykonávat některé enzymatické funkce (štěpení esterové vazby, katalýza, polymerace)
mRNA - messenger RNA (5-10%) - přenáši genetickou informaci o pořadí aminokyselin eukaryot z buněčného jádra do cytoplazmy k místu proteosyntézy.
tRNA - transferová RNA (10-20%) podílí se na proteosyntéze tím, že připojuje specifickou aminokyselinu do rostoucího polypeptidového řetězce při translaci.
rRNA - ribozomální RNA (50-80%) podílí se spolu specifickými bílkovinami na tvorbě ribozomu.